По признанию специалистов в области права, наиболее сложными для грамотной трактовки являются вопросы, связанные с налогом на добавленную стоимость. Множество изменений, дополнений, методических указаний и разъяснений к Закону сделали его достаточно объемным и сложным для восприятия. Кроме того, некоторые положения, несмотря на все усилия правоустанавливающих органов, остаются недостаточно четко прописанными.